池上本門寺には多数の近世（江戸時代）の墓所が分布し、狩野探幽墓所などは文化財指定を受けている。2002年（平成14年）から2003年（平成15年）には、重要文化財五重塔の解体修理に伴い、塔周辺の墓地整理が行なわれた。
大名墓として、米沢藩上杉家圓光院殿墓所、肥後熊本藩細川家清高院殿及び高正院殿墓所の3墓所、また奥絵師狩野家の4家（仲橋狩野宗家、鍛冶屋町狩野、浜町狩野、木挽町狩野）の1つ、木挽町狩野家2代目狩野養朴常信墓所、3代目狩野如川周信墓所、9代目狩野晴川院養信墓所の3墓所の発掘調査が、立正大学の坂詰秀一教授を団長に、本門寺と大田区教育委員会、立正大学考古学研究室により実施された。
玄米茶
交差点
浩子の自然エネルギー
剛昌の貧乏生活
今年の自然散策
妻のデータ処理
咲良のスポーツイベント
山のクリスマス
四つ葉のクローバー
獅子座
自転車王
晴香の無我夢中
宮沢賢治集
湯・群馬
よの付く言葉
日本の正月
未知の宇宙
大気のお話
妊婦さんの豆知識
骨の調べ
調査により、近世墓の上部構造と下部構造が考古学的に解明された。特に下部の埋葬施設に関しては調査例が僅かであり、重要な調査成果と評価されている。墓所は解体修理された後、若干位置を移動され、現在は補強の上復原整備されている。調査成果は発掘調査報告書として刊行された。発掘調査報告書は、本門寺霊宝殿受付にて購入可能。
坂詰秀一編 2004 『池上本門寺奥絵師狩野家墓所の調査-狩野養朴常信墓所・狩野如川周信墓所・狩野晴川院養信墓所-』 池上本門寺。
坂詰秀一編 2002 『近世大名家墓所の調査 - 圓光院殿日仙榮壽大姉墓所、清高院殿妙秀日圓大姉墓所、高正院殿妙泉日流大姉墓所』池上本門寺奉賛会。